Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lhx9Q9WUH2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms