Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stub1Q9WUD1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms