Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim3Q9R1R2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim3Q9R1R2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms