Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubd1Q9R1K7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubd1Q9R1K7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms