Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrpxQ9R0M3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrpxQ9R0M3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrpxQ9R0M3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SrpxQ9R0M3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrpxQ9R0M3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrpxQ9R0M3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrpxQ9R0M3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SrpxQ9R0M3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms