Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod1Q9R0E2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod1Q9R0E2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms