Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Plod3Q9R0E1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms