Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr54Q9R0D8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms