Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Plod2Q9R0B9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms