Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ercc4Q9QZD4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms