Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn8Q9QZ49 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn8Q9QZ49 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms