Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Slco1a1Q9QXZ6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Slco1a1Q9QXZ6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Slco1a1Q9QXZ6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Slco1a1Q9QXZ6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slco1a1Q9QXZ6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Slco1a1Q9QXZ6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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