Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nufip1Q9QXX8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nufip1Q9QXX8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms