Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXL8

Nme7, Nucleoside diphosphate kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme7Q9QXL8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme7Q9QXL8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme7Q9QXL8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms