Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apbb1Q9QXJ1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apbb1Q9QXJ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms