Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpc5Q9QX29 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms