Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Reep6Q9JM62 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms