Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tgm1Q9JLF6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms