Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CubnQ9JLB4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CubnQ9JLB4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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