Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arl6ip1Q9JKW0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms