Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chrac1Q9JKP8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms