Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms