Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms