Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trem1Q9JKE2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms