Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp5Q9JKD3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms