Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Uchl3Q9JKB1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uchl3Q9JKB1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms