Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pard6bQ9JK83 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pard6bQ9JK83 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms