Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2j1Q9JJZ4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms