Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gfra4Q9JJT2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gfra4Q9JJT2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms