Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PigbQ9JJQ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms