Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx4Q9JJN2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfhx4Q9JJN2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms