Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ercc6l2Q9JIM3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms