Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppp1r3fQ9JIG4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms