Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Exosc9Q9JHI7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Exosc9Q9JHI7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms