Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn12Q9ET43 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms