Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim2Q9ESN6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms