Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp29Q9ES63 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp29Q9ES63 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp29Q9ES63 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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