Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mkrn2Q9ERV1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mkrn2Q9ERV1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms