Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hipk3Q9ERH7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hipk3Q9ERH7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms