Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn4aQ9ER60 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn4aQ9ER60 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms