Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnn1Q9EQR3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn1Q9EQR3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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