Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Ndst3Q9EQH7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ndst3Q9EQH7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ndst3Q9EQH7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ndst3Q9EQH7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ndst3Q9EQH7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ndst3Q9EQH7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Ndst3Q9EQH7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Ndst3Q9EQH7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ndst3Q9EQH7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms