Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpsf1Q9EPU4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpsf1Q9EPU4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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