Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clstn1Q9EPL2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn1Q9EPL2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms