Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdf2Q9DCT5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdf2Q9DCT5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms