Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Abcg8Q9DBM0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Abcg8Q9DBM0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms