Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Med27Q9DB40 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Med27Q9DB40 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms