Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrmuQ9DAT5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms