Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc89Q9DA73 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms