Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9S1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D9S1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms